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Se trouvent ici les différents posts de ce blog.

• 2024

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• Lire des fichiers H'XML / HPRIM-XML avec python/pola.rs ou R
  21-09-2024

  Comment lire facilement des fichiers H’XML avec Python ou R ? Plusieurs solutions abordées dans ce billet.

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• Découverte de delta lake avec pola.rs et pypmsi
  21-09-2024

  Take delta lake for a spin

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• pmeasyr au congrès EMOIS 2024
  03-04-2024

  
  

  Un poster “pmeasyr / pypmsi : des communs en santé pour l’information médicale des établissements, et plus si affinités” sera présenté au congrès EMOIS 2024 qui se déroulera au Grand Palais de Lille les 4 et 5 avril 2024.

  Retrouvez l’intégralité du programme ici :

  https://www.emois.org

  Un atelier nommé “R pour le PMSI” aura également lieu vendredi matin.

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• pmsi::io : un logiciel pour lire les in / out du PMSi et les exporter en csv, xlsx, txt, json et parquet
  03-04-2024

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• 2023

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• Questionnaire PMSI avec R / python
  09-08-2023

  Un questionnaire a été mis en ligne pour en savoir plus sur les utilisateurs et les utilisations des packages :

  • pmeasyr
  • nomensland
  • pypmsi

  Cliquer ici pour répondre au questionnaire !

  
  

  

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• Quarto + pypmsi
  04-05-2023

  Voir le notebook ici :

  Notebook python Quarto (html)

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• Reproduire des in / out MCO à partir des zip.zip.zip de Druides
  18-04-2023

  Comment regénérer avec R des in / out sur la version de test de Druides 0.7.4.0 ?

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• pypmsi : lire des fichiers PMSI avec python / polars
  11-03-2023

  

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• 2022

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• Comprendre l'évolution de valorisation e-PMSI entre deux envois MCO rsa avec R
  11-10-2022

  Dans une année de collecte des informations du PMSI dans un hôpital,
  il y a des périodes où l’on cherche particulièrement à concentrer l’optimisation des envois.

  Lorsque ces efforts semblent porter leurs fruits, il peut être intéréssant de détailler :

  • sur quels types de séjours
  • sur quelles rubriques e-PMSI
  • pour quelles raisons (quelles actions)

  la revalorisation T2A s’opère.

  Ce post présente une manière de le faire concordante avec les tableaux SV et RAV d’ePMSI. Il utilise le package pmeasyr et dplyr.

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• Trying to reproduce a map of the greater Paris area from APUR with ggplot2, a moment for coloring
  30-01-2022

  In 2016, APUR the Paris urbanism agency published a map that described new Greater Paris area, see here.

  At this time I was interested to reproduce this map in R with official datas/shapefiles and ggplot2.

  A moment for coloring.

  

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• 2021

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• Using RSelenium to scrape a paginated HTML table
  12-04-2021

  Trying to answer this question on stackoverflow about understat.com scraping I was interested to take RSelenium for a spin.

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• Eyes on RT-PCR tests with echarts and french open data -- COVID-19
  31-01-2021

  Data on COVID-19 screening tests for France ; a shared dashboard with calendar and other heatmaps

  

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• 2020

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• data / capta : Interroger le concept de donnée à l'heure du HealthDataHub avec une application portée sur l'information médicale
  23-10-2020

  La tentation de l’idéalisme vient peut-être du mot même de données qui décrit aussi mal que possible ce sur quoi s’appliquent les capacités cognitives ordinaires des érudits, des savants et des intellectuels. Il faudrait remplacer ce terme par celui, beaucoup plus réaliste, d’obtenues et parler par conséquent de bases d’obtenues, de sublata plutôt que de data.¹

  1. Latour, B., « Pensée retenue, pensée distribuée », 2007, p. 609. ↩

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• Creative commons in the meantime
  16-08-2020

  Just a little post about sharing code and skills with the unknown.

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• Eyes on PCR tests with french open data -- COVID-19
  16-08-2020

  

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• Eyes on first wave with french open data -- COVID-19
  22-05-2020

  

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• Partage et formation à R, au tidyverse : for free - 2
  20-05-2020

  Des ressources pour découvrir R et s’entraîner

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• Partage et formation à R, au tidyverse : for free - 1
  20-05-2020

  Un propos sur la communauté R & PMSI

  Propos rédigés avant la crise COVID-19, publication volontairement à retardement

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• Dimonade
  15-02-2020

  

  Accéder aux nomenclatures et classifications du PMSI sans sourciller

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• 2019

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• dplyr and Oracle database with odbc on windows
  12-11-2019

  RStudio makes Oracle accessibility from R easier via odbc and connections Pane¹.
  Personally, I find it’s not so easy.
  As it finally works for me, I will detail some snippets here.

  1. RStudio documentation for Oracle connections: https://db.rstudio.com/databases/oracle/ ↩

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• A duck. Giving a look at DuckDB since MonetDBLite was removed from CRAN
  26-10-2019

  You may know that MonetDBLite was removed from CRAN.
  DuckDB comming up.

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• Under Pi : gganimate test around quadrature of the circle
  02-05-2019

  

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• Prêt pour M03 2019 - un point sur les nouveautés de pmeasyr
  13-04-2019

  Suite à la mise à jour des formats pour M03 2019, je présente les nouveautés ajoutées dans pmeasyr.

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• Strength of a Lennon song exposed with R function glue::glue
  25-03-2019

  

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• reciproceed : recipe, proceed, reciprocally
  11-03-2019

  use R, YAML and bookdown to automate generation of procedure books

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• stringfix : adding transcoder shiny app
  10-02-2019

  

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• pmeasyr en images
  09-02-2019

  Créer des images pour présenter du code à l’aide de carbon.

  

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• stringfix : new R package for string manipulation in a %>% way
  24-01-2019

  I usually write around here in french and mainly report on French Hospitals data managment and the statistical tasks they imply. As today’s post is about a new package I have created, I’ll be writing in english. The package is called stringfix because it uses infix operators to manipulate character strings.

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• 2018

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• Indications spécialités pharmaceutiques : format des fichcomp med à jour
  27-09-2018

  

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• Historique des coefficients géographiques
  19-06-2018

  Quelles évolutions pour les coefficients géographiques, depuis 2007 ?

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• Lister les travaux connexes avec R et les visualiser
  07-06-2018

  Ce post pour annoncer une visualisation des travaux connexes/annexes à pmeasyr accessibles ici.

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• Applications : listes des manuels de GHM
  18-05-2018

  Lors d’un précédent post, je présentais une application Shiny, Transcodeur, en ligne et ouverte à tous pour faciliter la manipulation de codes CIM-10 et CCAM.

  Aujourd’hui, je présente d’autres applications dont l’objectif est la mise à disposition des listes de diagnostics et codes CCAM des manuels de GHM sous un format agréable, ces listes qui orientent vers des racines de GHM.

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• Et tout le toudim
  04-05-2018

  Annonce d’un mini-blog pour le partage de méthodes autour des données PMSI : “Et tout le Toudim”

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• Formats 2018 : ok ; et digression cartographique
  04-05-2018

  Utiliser pmeasyr sur les données M03 à M12 2018, en attendant 2019. Présentation d’un code pour faire une mappemonde interactive avec R.

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• Fonctions de requêtage dans pmeasyr
  02-03-2018

  Rédiger, structurer simplement des requêtes PMSI, pouvoir les réutiliser et les partager.

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• Mars en attendant... 2018, M01 & M02
  02-03-2018

  Utiliser pmeasyr sur les données M01 et M02 2018, en attendant M03.

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• 2017

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• Administrer les tables dans une base de données avec pmeasyr et DBI
  15-09-2017

  Intégrer les données pmsi dans une base monetdb.

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• Arborescence des archives homogène ~/Documents/data
  15-09-2017

  “Une arborescence de travail commune pour envisager des programmes communs.”

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• Vidéo de présentation du package
  29-06-2017

  Une vidéo youtube permet de découvrir la documentation, l’utilisation du package et de Transcodeur.

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• Aide en ligne avec pkgdown
  17-06-2017

  Une page d’aide en ligne réalisée avec pkgdown

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• Formats PMSI 2017 et nouveautés : mise à jour du package pmeasyr
  09-04-2017

  Mise à jour des formats pour 2017 et nouvelles fonctionalités.

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• Transcodeur : manipuler des listes de codes
  05-04-2017

  Une application Shiny pour ne plus s’embêter à manipuler des listes de codes (Cim, CCAM, GHM, …) à la main.

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• Flux d'import avec pmeasyr et %>%
  07-03-2017

  Rédiger ses imports autour d’un noyau de paramètres avec noyau_pmeasyr.

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• Alléger les scripts utilisant pmeasyr avec do.call
  28-02-2017

  Une nouvelle manière de rédiger les scripts d’imports.

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• Split du fichier rsfa (rafael) avec python et import dans R
  27-02-2017

  Quelques astuces pour traiter les volumineux fichiers rsfa.

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• Sujet introductif
  26-02-2017

  Bienvenue, ce blog rassemble les informations autour du package R pmeasyr.

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