14 requetr : rédiger, exécuter des requêtes pmsi

Cette partie de pmeasyr concerne la rédaction et l’exécution de requêtes pmsi. Quelques exemples d’abord puis une présentation de ce qu’il est possible de faire avec (et, de manière complémentaire, de ce qu’il n’est pas possible de faire).

14.1 Définir une requête

14.1.1 Exemple simple

requete_simple <- list(
  actes = "EPLF002", 
  activites_actes = "1"
)

Ici on cherchera tous les séjours avec un acte EPLF002 codé en activité 1.

14.1.2 Exemple plus complexe

requete_complexe = list(diags = "E66", 
                        positions_diags = 5, 
                        dureemax = 0,
                        ghm = '28Z',
                        agemax = 18,
                        diags_exclus = "C")

# positions_diags : 1 dp rsa, 2 dr rsa, 3 dp um, 4 dr um, 5 das

Ici on cherchera tous les séjours avec un diagnostic E66 en das, d’une durée de 0 jour, avec un ghm en 28Z, où l’âge du patient est au maximum 18 ans, et sans aucun diagnostic commençant par C.

14.2 Requêtes sur des rsa importés avec irsa

Il faut d’abord importer les rsa avec un type d’import 6 et “préparer les rsa” avec la fonction prepare_rsa() :

irsa(p, typi = 6) -> rsa
prepare_rsa(rsa) -> rsa

Exemple de requêtes :

exemple_requete <- list(
  actes = c('QEFA003','QEFA005','QEFA010','QEFA013','QEFA015','QEFA019','QEFA020')
)

La commande suivante renvoie un tibble (tableau) contenant les clés rsa correspondants à cette requête :

requete(rsa, exemple_requete)

Il est possible de retourner d’autres variables que la clé rsa uniquement, en les spécifiant :

requete(rsa, exemple_requete, vars = c('nas', 'agean', 'actes', 'diags', 'ghm'))

14.3 Requêtes sur des rsa dans la base de données

C’est le même principe seulement il faut spécifier la connexion à la table et l’année de la requête plutôt que l’objet rsa :

requete_db(con, 16, exemple_requete, vars = c('nas', 'agean', 'actes', 'diags', 'ghm'))

14.4 Éléments possibles pour une requête

Élément	Commentaire
agemin	Âge minimum en années (inclus)
agejrmin	Âge minimum en jours (inclus)
agejrmax	Âge maximum en jours (inclus)
agemax	Âge maximum en années (inclus)
dureemin	Durée minimum en jours (inclus)
dureemax	Durée maximum en jours (inclus)
ghm	Liste de ghm ou racine de ghm : exemple : 08C24, 08C241
diags_exclus	Diagnostics à exclure en toutes positions
poidsmin	Poids minimum (inclus)
poidsmax	Poids maximum (inclus
ghm_exclus	ghm à exclure en toutes positions
autres	Autres éléments de requête au niveau rsa partie fixe, exemple ‘agegest < 37’
diags	Diagnostic ou liste de diagnostics à rechercher
positions_diags	Positions des diagnostics à chercher, voir les positions de la table diags (de 1 à 5)
actes	Acte ou liste d’actes à rechercher
activites_actes	Activité pour laquelle chercher les actes

14.5 Lancer plusieurs requêtes

Les fonctions lancer_requete() et lancer_requete_db() permettent de lancer une ou plusieurs requêtes lorsque l’on a défini une liste de requêtes.

14.5.1 Exemple de liste de requêtes

deux_requetes <- list(requete_1 = list(actes = "EBLA003", nom = "pac", thematique = "pac"),
                      requete_2 = list(ghm = "28Z", nom = "seances", thematique = "CMD 28")
)

14.5.2 Lancement

# Pour des rsa importés avec irsa
lancer_requete(rsa, deux_requetes, vars = c('nas', 'duree', 'ghm'))

# Pour des rsa dans une base de données
lancer_requete_db(con, 16, deux_requetes, vars = c('nas', 'duree', 'ghm'))

La commande suivante renvoie un tibble (tableau) contenant les clés rsa correspondants à ces requêtes avec deux variables identifiant le nom et la thématique de la requête correspondante.